PCBde puhastusmeetod tuleb valida vastavalt saastetüübile ja kasutusstsenaariumile; üks-suurus-sobib-kõigile lähenemine pole võimalik. Tavaliseks puhastamiseks pärast tootmist või remonti on kõige levinum meetod veevaba alkoholi või spetsiaalsete elektrooniliste puhastusvahenditega pühkimine. Need lahustid aurustuvad kiiresti ja jätavad vähe jääke, mistõttu sobivad räbustijääkide, kergete õliplekkide ja tolmu eemaldamiseks. Töötamise ajal kasutatakse tavaliselt ebemevaba lappi või pehmet harja, et pühkida õrnalt piki vooluringi joonte suunda, vältides liigset jõudu, mis võib komponente lahti saada või jooteühendusi kahjustada. Tugeva lokaalse saastusega piirkondade puhul võib kasutada punktist -punktini-puhastusmeetodit, mis lahendab probleemi järk-järgult, mitte ei pühkida korduvalt suuri alasid.
Kui PCB-l on tõrksaid saasteaineid, nagu kampol, tööstuslikud õliplekid või pikaajalisel oksüdatsioonil tekkinud jäägid, võib kaaluda ultraheli puhastamist. See meetod hõlmab trükkplaadi sukeldamist spetsiaalsesse puhastuslahusesse, kus kõrgsageduslike vibratsioonide tekitatud kavitatsiooniefekt eemaldab väikestest pragudest saasteained, mille tulemuseks on põhjalikum puhastus kui käsitsi. Siiski on oluline kontrollida puhastusaega ja vedeliku koostist, et vältida tundlike komponentide (nagu pistikud, releed ja mikrofonid) kahjustamist. Pärast puhastamist on oluline põhjalik kuivatamine; vastasel juhul võib jääkniiskus põhjustada lühiseid või korrosiooni.
